Năm U.C.0105, mười hai năm sau cuộc nổi loạn của Char. Tổ chức “Mafty” bắt đầu đứng lên chống lại sự cai trị độc tài của chính phủ Liên bang bằng cách ám sát các quan chức cấp cao. Thủ lĩnh của tổ chức này thực chất là Hathaway Noa — con trai của Bright Noa, người từng chiến đấu trong cuộc Chiến tranh Một Năm cùng Amuro Ray. Một cô gái tên Gigi Andalusia, sở hữu những năng lực kỳ lạ khó lý giải, đã khiến Hathaway nhớ lại một chấn thương trong quá khứ. Dù bối rối trước những lời nói đầy ẩn ý của cô, anh vẫn chuẩn bị tiến hành cuộc không kích nhằm vào Hội nghị Adelaide, quyết tâm hoàn thành mục tiêu của Mafty và khép lại quá khứ của chính mình. Trong khi bị dao động bởi những lời tiên tri bí ẩn ấy, Hathaway vẫn tiếp tục chuẩn bị cho chiến dịch của Mafty — cuộc tấn công vào Hội nghị Adelaide. Trong khi đó, Kenneth Sleg thuộc Lực lượng Liên bang đang lên kế hoạch phòng thủ cho Hội nghị Adelaide, đồng thời chuẩn bị chiến dịch tiêu diệt Mafty, thì bất ngờ được Handley Yoxon của Tổ chức Cảnh sát Hình sự tiếp cận với một đề nghị mật. Khi Hathaway và Kenneth theo đuổi những mục tiêu riêng của mình, Gigi cũng lên đường tới Hồng Kông để hoàn thành vai trò mà cô mang trên vai.